هرساله تعداد قابل توجهی از پروژه های پژوهشی و فناوری در پژوهشکده علوم محیطی و به سفارش مراکز و سازمان های مختلف انجام میشود که اغلب آنها کاربردی بوده، در زمینه های زیر انجام میشود:
فناوری های نوین تصفیه آب و فاضلاب
استقرار نظام اقتصاد سبز
مكان يابي توسعه و استقرار صنایع
شناسایی گونه های گياهي و جانوري
انجام خدمات نمونه برداري و آزمايشگاهي
پايش كيفيت فيزيكي/ شيميايي/ ميكروبي
تدوین استانداردهای محيط زيست
ارزشگذاري اقتصادي منابع طبیعی و تعیین هزينه هاي ناشی از تخریب محیط زيست