هدف از این آزمایشگاه تجارب عملی برای تحقق مفاهیم دانش «اگرواکولوژی» است. از آنجا که کاربرد مفاهیم و اصول اگرواکولوژی در طراحی و مدیریت سامانه‌های غذایی پایدار مطرح می شود، چنین آزمایشگاهی برای انجام رویکرد تجربی در آموزش و پژوهش اگرواکولوژی ضروری است. این آزمایشگاه دارای پنج بخش اساسی شامل بررسی عوامل محیطی از جمله تغییر اقلیم، پویایی تنوع جمعیت در سامانه‌های زراعی، برهم‌کنش‌های جوامع زراعی، چگونگی مطالعات میدانی و سامانه مزرعه، مطالعات سامانه غذایی است که هر یک با پیچیدگی متفاوت بر اکولوژی بوم سامان‌های کشاورزی تمرکز دارند. دانشجویان و اعضای هیات‌علمی محترم تجهیزات و امکانات آزمایشگاه اگرواکولوژی و تجزیه و تحلیل سامانه‌های محیط زیستی را در مدیریت و تفسیر داده‌ها در پژوهش‌های خود استفاده خواهند نمود.